急性低血压分子机制解析:生物信息学驱动的靶点筛选与通路挖掘
目的:基于多维度生物信息学技术,系统解析急性低血压的分子病理机制。方法:整合GEO数据库(GSE2401)的基因表达谱,采用limma包(R软件)筛选差异基因,通过数据降维(log2(FC)>1, P<0.05)优化靶点;进一步结合GO、KEGG及GSEA通路富集及STRING-Cytoscape(MCODE、CytoHubba插件)构建PPI网络,挖掘核心基因;实现“差异基因-功能通路-蛋白互作网络”的全链条分析。结果:发现676个差异基因(304上调,372下调),核糖体结构成分(Rps8、Rps27、Rpl35等)及FOXO、cAMP等多通路协同调控急性低血压进程。结论:本研究运用了一套低成本、高效的生物信息学分析框架,揭示了核糖体功能失调、胰岛素信号效能变化与血压调控的关联,为靶向治疗提供新思路。
AIM: Based on multi-dimensional bioinformatics technology, the molecular pathological mechanism of acute hypotension is systematically analyzed. METHODS: Integrate the gene expression profile of the GEO database (GSE2401), use limma package (R software) to screen differential genes, and optimize targets through data dimensionality reduction (log2(FC)>1, P<0.05); further combine GO, KEGG and GSEA pathway enrichment and STRING-Cytoscape (MCODE, CytoHubba plug-in) to build a PPI network to mine core genes; realize the full-chain analysis of differential gene - functional pathway - protein interaction network. RESULTS: 676 differential genes (304 upregulated, 372 downregulated), ribosome structural components (Rps8, Rps27, Rpl35, etc.) and multiple pathways such as FOXO and cAMP were found to coordinate the regulation of acute hypotension. CONCLUSION: This study uses a low-cost and efficient bioinformatics analysis framework to reveal the association between ribosomal dysfunction, changes in insulin signal efficacy and blood pressure regulation, providing new ideas for targeted therapy.
梅雨婷、周宙、张璇、范慧敏、周梦雪、王贤良
1.天津中医药大学第一附属医院/国家中医针灸临床医学研究中心;2.天津中医药大学1.天津中医药大学第一附属医院/国家中医针灸临床医学研究中心;2.天津中医药大学天津中医药大学第一附属医院/国家中医针灸临床医学研究中心1.天津中医药大学第一附属医院/国家中医针灸临床医学研究中心;2.天津中医药大学1.天津中医药大学第一附属医院/国家中医针灸临床医学研究中心;2.天津中医药大学天津中医药大学第一附属医院/国家中医针灸临床医学研究中心
医药卫生理论医学研究方法生物科学研究方法、生物科学研究技术分子生物学基础医学
急性低血压GEO数据库生物信息学病理机制核糖体功能失调胰岛素信号效能变化
cute HypotensionGEO DatabaseBioinformaticsPathological MechanismRibosome Dysfunctionhanges in insulin signal efficacy
梅雨婷,周宙,张璇,范慧敏,周梦雪,王贤良.急性低血压分子机制解析:生物信息学驱动的靶点筛选与通路挖掘[EB/OL].(2025-05-16)[2025-08-19].https://www.biomedrxiv.org.cn/article/doi/bmr.202507.00047.点此复制
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