应用Illumina-MiSeq高通量测序技术分析脱氧雪腐镰刀菌烯醇对小鼠肠道菌群的影响
本试验旨在研究脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)对小鼠肠道微生物多样性、物种丰度的影响。选用平均体重为20 g的BALB/c小鼠40只,随机分成对照组(灌胃灭菌生理盐水)和DON组(灌胃1.8 mg/kg BW DON),每组20个重复,每个重复1只小鼠,连续灌服28 d。试验结束后,收集新鲜粪便,每组随机选取3份,用Illumina-MiSeq高通量测序技术分析微生物群落结构和组成的变化。结果表明,1)与对照组相比,DON组测序数量减少(P大于号0.05)。2)DON组降低了Alpha、Beta多样性,Shannon指数较对照组显著降低(P小于号0.05)。3)在门水平,与对照组相比,DON组显著降低了Bacteroidetes和Deferribacteres的物种丰度(P小于号0.05),显著提高了Proteobacteria的物种丰度(P小于号0.05)。在属水平,与对照组相比,DON组显著降低了Parabacteroides、Rikenella、Algoriphagus、Mucispirillum、Methylophilus、Francisella的物种丰度(P小于号0.05),显著提高了Clostridium、Robinsoniella、Allobaculum、Akkermansia的物种丰度(P小于号0.05)。4)聚类分析显示,DON组与对照组的肠道微生物相似性降低。由此可见,DON能显著影响小鼠肠道微生物菌群多样性及物种丰度,提示DON致肠道损伤与这些肠道菌群的变化密切相关。
郭晋丽、赵志辉、杨俊花、郭文博
微生物学生物科学研究方法、生物科学研究技术基础医学
高通量测序脱氧雪腐镰刀菌烯醇肠道微生物
郭晋丽,赵志辉,杨俊花,郭文博.应用Illumina-MiSeq高通量测序技术分析脱氧雪腐镰刀菌烯醇对小鼠肠道菌群的影响[EB/OL].(2017-11-07)[2025-08-02].https://chinaxiv.org/abs/201711.01515.点此复制
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