河豚白细胞介素-2基因鉴定及其生物信息学分析

利用比较基因组学方法，在河豚（Takifugu rubripes）基因组中鉴定了IL-2基因（FrIL-2）。该基因为单拷贝基因，由4个外显子和3个内含子组成，编码149个氨基酸。基因上游调控区含NF-IL6、GATA-1、Nkx-2.5、SRY、MyoD和Hb等转录因子结合位点，3’UTR含AATAAA加尾信号和8个ATTTA转录不稳定序列；所编码的FrIL-2蛋白分子量为16.7 kD，等电点为4.30，N端含22个氨基酸组成的信号肽，肽链内含8个Cys，其中和生物学活性相关的Cys-66和Cys-116高度保守，在结构上存在一个类似IL-2特征性功能域结构{T-E-[LF]-x(2)-L-x-C-L-x(2)-E-L}，此外还存在3个潜在的CKⅡ磷酸化位点，1个酪氨酸激酶磷酸化位点，1个蛋白酶C磷酸化位点，1个N-糖基化位点和1个N端酰基化位点；二级结构包括4个α螺旋区，4个β折叠片以及8个转角区。比较河豚与人、哺乳动物、鸟类等IL-2的同源性，其氨基酸序列相似性为25％~34％。研究结果为今后利用鱼类基因组数据库和生物信息学快速鉴定新的鱼类功能基因打下了方法学基础，也为进一步开展鱼类IL-2基因功能研究提供了科学依据。